Sequence Read Archive

次世代シークエンサから出力される生データとアライメントデータをアーカイブしています。

Trace Archive

シングルパスリードの sequence chromatograms (traces), base calls, quality estimates をアーカイブしています。

Nucleotide Sequence Database

アノテーションが付加された塩基配列データをアーカイブしています。

Omics Archive

MIAMEMINSEQE ガイドラインに準拠した functional genomics data をアーカイブしています。

BioProject

研究プロジェクトを格納し,複数のアーカイブに登録されたデータをプロジェクト単位でまとめます。

BioSample

データを得るために使われた生物学的なサンプル情報を集中管理するデータベースです。

Japanese Genotype-phenotype Archive

個人に由来する遺伝学的なデータと匿名化された表現型情報を保存し,提供しています。データが収集された個人との間の同意に基づく協定により,データ利用は特定の研究目的に制限されています。

Read Annotation Pipeline

次世代シークエンスデータを解析するためのクラウドタイプのパイプラインです。